for ($a = 0; $a < count($proveedores); $a++){
	echo "-Proveedor: ".$proveedores[$a]."<br>";
	for ($e = 0; $e < count($ubicaciones); $e++){
		for ($i = 0; $i<count($Resumen[articulo]); $i++) {
			if ($Resumen[proveedor][$i] == $proveedores[$a]){
				if ($Resumen[ubicacion][$i] == $ubicaciones[$e]){
					if ($ubicaciones[$e] != $ubicant){
						echo "---Ubicacion: ".$ubicaciones[$e]."<br>";
						$ubicant = $ubicaciones[$e];
					}
					echo "-----Articulo: ".$Resumen[articulo][$i]."<br>";
				}
			}
		}
	}
	unset($ubicant);
}

RESULTADO:
-Proveedor: 247
---Ubicacion: CV1E
-----Articulo: 65584
-Proveedor: 268
-Proveedor: 244
---Ubicacion: CV1E
-----Articulo: 65737
---Ubicacion: CA9
-----Articulo: 65694