Es wird zunächst ein neuer Boot-Loader {\tt ldlinux.sys} auf der Diskette installiert. Danach werden die Dateien {\tt syslinux.cfg} (Boot-Loader Konfiguration), {\tt kernel} (Das eigentliche Linux), {\tt rootfs.img} (Das Ur-Dateisystem von fli4l), {\tt rc.cfg} (Die fli4l Konfigurationsdatei) sowie {\tt opt.img} (Zusätzliche Programme) kopiert. In früheren Versionen reichte es, bei einer Konfigurationsänderung nur die Dateien {\tt rc.cfg} und {\tt opt.img} zu kopieren. Das ist bei aktuellen Versionen nicht mehr der Fall, hier wird sogar der Kernel in Abhängigkeit von der Konfiguration ausgewählt. Man sollte also sicherheitshalber immer alles kopieren.