Header.php kodlarında

<div id="header">

<!--BURAYA a etiketini ekle-->
<a class="atHead" href="http://www.beyaznokta.org.tr"></a>

<h1 class="blogtitle">Beyaz Nokta® Gelişim Vakfı</h1>
<p class="description">Gelişmiş Çağdaş Bir Türkiye için Daha Yüksek Sorun Çözme Kabiliyeti</p>
</div>

CSS dosyanıda açıp şu kodları ekleyebilirsin

#header a.atHead {position:absolute;width:240px;height:75px;margin-left:150px;margin-top:50px}

Bu koddaki width ve heighti logonun boyutları ne kadar ise o kadar gir. margin-left ve top kullanarak a tagını logoya tam olarak oturt.