arq_atual = open("C:/compara/arq_atual.txt", "r").readlines()
arq_novo = open("C:/compara/arq_novo.txt", "r").readlines()
arq_saida = open("C:/compara/abre.txt", "w")

for linha_atual in arq_atual:
    for linha_nova in arq_novo:
        if linha_atual == linha_nova:
            print "São iguais"
            arq_saida.write(linha_atual)
        else:
            print "Os caracteres na posição Atual = " + linha_atual + " e Novo = " + linha_nova
            arq_saida.write(linha_atual)
arq_saida.close()